首個肺癌全息細胞圖譜問世

近日，**學(xué)術(shù)期刊《Nature Medicine》重磅推出了史上最完整的肺癌細胞圖譜！這將是科學(xué)家們在細胞層面深入了解肺癌真相的**契機！

來自魯汶大學(xué)等機構(gòu)的研究人員通過對數(shù)以千計的健康與癌變肺細胞的研究，創(chuàng)建了史上**個完整的肺癌細胞圖譜。他們的研究結(jié)果表明，肺癌比以前認識的復(fù)雜得多，其包含了52種不同類型的基質(zhì)細胞，這些新信息可用于開發(fā)新的肺癌治療途徑。該研究結(jié)果以《Phenotype molding of stromal cells in the lung tumor microenvironment》為題發(fā)表。

要從細胞層面上研究肺癌，就必須談到一個詞—腫瘤微環(huán)境（TME）。就像植物生長需要營養(yǎng)豐富的土壤和水源一樣，腫瘤周圍的組織、免疫細胞、血管和細胞外基質(zhì)共同形成的TME對腫瘤的生長和侵襲至關(guān)重要。腫瘤與環(huán)境，兩者既是相互依存，相互促進，又是相互拮抗，相互斗爭的。

研究人員使用單細胞RNAseq技術(shù)研究了近100000個個體細胞，呈現(xiàn)了人肺癌TME轉(zhuǎn)錄組的52698個細胞目錄，并在獨立樣本中驗證，同時對其中40250個肺癌細胞進行測序。

首先，研究人員在肺癌TME中發(fā)現(xiàn)了可以指導(dǎo)表達不同膠原蛋白的成纖維細胞、下調(diào)免疫細胞歸巢的內(nèi)皮細胞和與已建立的免疫檢查點轉(zhuǎn)錄本以及與T細胞活性相關(guān)的基因。隨后，他們對來自1572名肺癌患者的大量RNA測序數(shù)據(jù)進行評估，證明了這些基因的存在，并通過免疫組化驗證了TME中存在獨立的細胞實體，而免疫熒光證實肺癌TME中存在四種內(nèi)皮細胞和成纖維細胞亞型，同時還有一些免疫亞型的單細胞。

通過與匹配的非惡性肺部樣本進行比較，研究人員揭示肺癌存在高度復(fù)雜的TME，它可以深刻地塑造基質(zhì)細胞。他們共鑒定了52種基質(zhì)細胞亞型，繪制了史上最完整的肺癌細胞圖譜，其中包括迄今仍被認為是同質(zhì)細胞類型中的新亞群，以及其異質(zhì)性的轉(zhuǎn)錄因子，說明了肺癌微環(huán)境遠比我們想象的復(fù)雜。

同時，研究人員還指出這些細胞亞型與患者存活率存在關(guān)聯(lián)。他們發(fā)現(xiàn)基質(zhì)細胞數(shù)量可以反映癌細胞的侵襲性，腫瘤的侵襲性越強，就含有越多的基質(zhì)細胞。因此，這些基質(zhì)細胞亞型及其特異性標記基因有機會作為肺癌的預(yù)后以及治療反應(yīng)預(yù)測的生物標記。

該研究團隊的成員之一Bernard Thienpont教授認為，此次繪制出的肺癌全面圖譜能夠為科學(xué)家們提供一種研究細胞類型的基準，便于后期研究人員在體外或動物模型中對這些細胞類型進行深度研究。同時，這些基質(zhì)細胞亞型的生物標記作用，對患者的治療與預(yù)后評估也至關(guān)重要。