利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)揭示成神經(jīng)管細(xì)胞瘤不同亞型的細(xì)胞組成

成神經(jīng)管細(xì)胞瘤（medulloblastoma）是一種惡性兒童小腦腫瘤類型，包含不同的分子亞型。成神經(jīng)管細(xì)胞瘤已被分為四種不同的分子亞型：WNT和SHH（均由它們的同名基因發(fā)生的突變驅(qū)動），組3和組4。組3和組4占所有成神經(jīng)管細(xì)胞瘤病例的60％，但是也最少被人理解的。這部分上是因為當(dāng)前沒有在遺傳上準(zhǔn)確地模擬組4的實驗室模型。

此外，盡管這些亞型的基因組特征已得到明確定義，但是細(xì)胞多樣性在多大程度上構(gòu)成了它們不同的生物學(xué)和臨床行為的基礎(chǔ)，在很大程度上仍未被探索。

在一項新的研究中，來自美國圣猶大兒童研究醫(yī)院、麻省總醫(yī)院、哈佛醫(yī)學(xué)院和布羅德研究所等研究機構(gòu)的研究人員利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究了囊括成神經(jīng)管細(xì)胞瘤所有4種分子亞型的25種成神經(jīng)管細(xì)胞瘤樣本中的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性和腫瘤間異質(zhì)性。相關(guān)研究結(jié)果于2019年7月24日在線發(fā)表在Nature期刊上，論文標(biāo)題為“Resolving medulloblastoma cellular architecture by single-cell genomics”。

這些研究人員發(fā)現(xiàn)WNT亞型、SHH亞型和組3亞型包含亞型特異性的未分化神經(jīng)元樣惡性腫瘤細(xì)胞群體和分化神經(jīng)元樣惡性腫瘤細(xì)胞群體，然而，組4亞型僅由分化的神經(jīng)元樣腫瘤細(xì)胞組成。

SHH亞型非常類似于處于與患者年齡相關(guān)的不同分化狀態(tài)的顆粒神經(jīng)元。組3和組4亞型顯示出從原始祖細(xì)胞樣細(xì)胞（progenitor-like cell）到更成熟的神經(jīng)元樣細(xì)胞（neuronal-like cell）的發(fā)育軌跡，而且這兩種細(xì)胞類型的相對比例可區(qū)分這兩種亞型。

跨物種轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析將不同的谷氨酸能神經(jīng)元群體定義為SHH亞型和組4亞型的推定細(xì)胞來源。

總之，這些數(shù)據(jù)對亞型特異性的成神經(jīng)管細(xì)胞瘤生物學(xué)的細(xì)胞狀態(tài)和發(fā)育狀態(tài)提供了新的見解。