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我國(guó)科學(xué)家發(fā)現(xiàn)胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤分子分型模型

2019-11-07 11:20來(lái)源:生物谷


近日,由北京協(xié)和醫(yī)院趙玉沛院士領(lǐng)銜,北京協(xié)和醫(yī)院吳文銘團(tuán)隊(duì)與深圳華大生命科學(xué)研究院吳逵團(tuán)隊(duì)合作在Gut雜志上發(fā)表了題為Whole-genome sequencing reveals distinct genetic bases for insulinomasand non-functional pancreatic neuroendocrine tumours: leading to a newclassification system的研究論文,探究胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤(PanNET)主要臨床分型的基因組水平差異。通過(guò)合作研究,利用多組學(xué)測(cè)序測(cè)序技術(shù),系統(tǒng)比較了胰島素瘤和非功能性小胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤(NF-PanNET)基因組水平差異,基于基因組拷貝數(shù)變異(CNV)及單堿基突變,提出了分子分型模型,并揭示CNV對(duì)NF-PanNETs預(yù)后的預(yù)測(cè)價(jià)值。

    

研究團(tuán)隊(duì)對(duì)比胰島素瘤及NF-PanNET基因組數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)胰島素瘤和NF-PanNET呈現(xiàn)出不同的突變特征。且在CNV層面上,胰島素瘤主要以拷貝數(shù)中性和拷貝數(shù)擴(kuò)增為主;NF-PanNET主要以拷貝數(shù)中性、拷貝數(shù)擴(kuò)增和拷貝數(shù)缺失為主;并以此提出5種亞型的分子分型。


通過(guò)比較分子分型模型中不同亞型預(yù)后,提示拷貝數(shù)擴(kuò)增、拷貝數(shù)缺失的NF-PanNET復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)較高;同時(shí),拷貝數(shù)擴(kuò)增、拷貝數(shù)缺失的NF-PanNET中DAXX/ATRX基因突變比例較高,聯(lián)合拷貝數(shù)變化及DAXX/ATRX基因突變有助于更精準(zhǔn)的預(yù)測(cè)NF-PanNET的復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)和時(shí)機(jī)。


綜上,該研究對(duì)胰腺神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤不同臨床亞型的基因組變化進(jìn)行了更深入研究,解釋了臨床分型與分子分型之間的關(guān)聯(lián),提出了新的預(yù)后判斷指標(biāo),為該疾病機(jī)制的研究、臨床的精準(zhǔn)治療提供了研究基礎(chǔ)。


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