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Actin與GAPDH做內(nèi)參區(qū)別2024-06-07 15:36
Actin與GAPDH作為內(nèi)參在多個(gè)方面存在區(qū)別,以下將分別從定義、分布、作用、結(jié)構(gòu)和應(yīng)用等方面進(jìn)行詳細(xì)闡述: 定義: Actin(肌動(dòng)蛋白):是細(xì)胞的一種重要骨架蛋白,分子量約為42kDa,基本上存在于所有真核細(xì)胞中。它作為內(nèi)參是指為了衡量基因組數(shù)據(jù)的可靠性,使用序列保守性來測(cè)定從基因組中提取的某些基因的表達(dá)水平作為參考。 GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶):是一個(gè)管家基因,在物種間是高度保守的。例如,人源的GAPDH由335個(gè)氨基酸組成,其全長有70%與Arabidopsis thaliana中由422個(gè)氨基酸組成的同源蛋白是相同的。GAPDH在western blot和PCR中都被用作參照。 分布: Actin:主要分布于細(xì)胞骨架中,是細(xì)胞運(yùn)動(dòng)、維持細(xì)胞形態(tài)和細(xì)胞分裂的重要成分。 GAPDH:廣泛分布于各種組織中的細(xì)胞,存在于胞漿、細(xì)胞核、核周區(qū)及膜上。 作用: Actin:β-Actin是PCR常用的內(nèi)參,其抗體也是Western Blot很好的內(nèi)參指數(shù)。 GAPDH:被廣泛用作抽提total RNA,poly(A)+ RNA,Western blot等實(shí)驗(yàn)操作的標(biāo)準(zhǔn)化的內(nèi)參。但值得注意的是,缺氧可上調(diào)GAPDH的表達(dá),導(dǎo)致GAPDH聚集,因此不能在涉及氧氣的相關(guān)研究中作為內(nèi)參。 結(jié)構(gòu): Actin與GAPDH在分子結(jié)構(gòu)和氨基酸序列上存在顯著差異,具體結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)需要查閱相關(guān)生物學(xué)資料。 應(yīng)用: Actin:主要應(yīng)用于生物化學(xué)與分子生物學(xué)、氨基酸、多肽與蛋白質(zhì)、細(xì)胞生物學(xué)等領(lǐng)域。 GAPDH:除了作為內(nèi)參用于實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)化外,其蛋白印跡法也常用于實(shí)驗(yàn)分析中。 總結(jié)來說,Actin和GAPDH作為內(nèi)參在定義、分布、作用、結(jié)構(gòu)和應(yīng)用上均有明顯的區(qū)別。在選擇內(nèi)參時(shí),應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)的具體需求和條件,綜合考慮這些因素,選擇最適合的內(nèi)參。
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